在做“清”文章的同时，同步加大“治”的力度。

治理重点污染河道——解决短板：结合本市水污染防治行动计划推进，集中实施水污染治理工程，通过截污治污、调活水体、营造水景、完善管理等措施，实现200公里重污染河道水质稳定，消除间歇性黑臭现象。

治理重点保护河道——改善水质：重点治理本市30万亩设施菜田及黄浦江上游、青草沙、陈行、东风西沙和金泽等饮用水水源保护区范围的周边河道，开展300公里中小河道整治，进一步改善区域内河道水质，确保饮用水源地和蔬菜灌溉用水安全。

治理重点区域河道——修复生态：结合市政府确定的新城新镇、郊野公园、美丽乡村等重点区域建设，集中连片、整体推进，配套实施500公里中小河道生态修复工程，全面提升区域水环境面貌，营造水生态文明建设亮点。